مسلمانان از طریق بندر زیلغ در کنار خلیج عدن وارد سومالی شده و اسلام را در قرن اول هجری در آن گسترش دادند.

شاخصه و خصیصه اسلام در سومالی، در آمیختگی شدید با سنت های محلی و مناسک مختلف، از جمله دوکو، مراسمات جذبه ای دیگری، سیارو با به زیارت قبور اولیا رفتن، برگزار کردن جشن های موالید است. اما وهابی ها و سلفی ها با انجام این دست مناسک به شدت مخالفند.

از زمان سقوط حکومت زیادباره، گروه های اسلامی در صحنه سیاسی سومالی، نقشی پررنگ تر یافته اند؛ در این میان، سه گروه مهم حضور دارند: اتحاد اسلامی (الاتحادالاسلامی)، اتحادیه دادگاه های (شریعت) اسلامی و الشباب.

عالمان الازهر (آنطور که دیوید مک کورمک) می¬گوید الهام گیرنده از وهابیت بودند. افراد سومالیایی که در این موسسات درس می خواندند از کمک های مالی و امتیازات فراوانی مانند غذا و مسکن رایگان، کمک هزینه تحصیل و ازدواج و بلیط سالانه رفت و برگشت سفر به مناطق مختلف برخوردار می شدند.